当作物是没有参考基因组时,需要无参进行比对。Trinity是现在使用最广泛的转录组De novo组装软件。 Trinity 是无参考转录组从头组装转录组的常用软件,且trinity的使用文档非常详细,整合的内容非常完整,包括从组装,比对,定量到差异分析等。因此有大神也推荐Trinity可作为初学者了解熟悉转录组分析流程的入门和进阶学习文档。
小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学的教程,以及基于R的分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!!