因为网络安全原因我们服务器就是离线状态,只能支持本地上传,因此软件安装和python包的安装都很麻烦,这里记录一下python模块离线安装的方法
首先python包下载地址有两个,我只试过第一个
官方下载网站:
https://pypi.python.org/pypi
其他第三方网站下载:
http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/
安装包一般有两种形式,两种形式安装皆可
1、tar.gz格式的源包
2、whl格式的包(记得下载对应系统支持的)
针对tar.gz下载下来后
tar -xzvf package.tar.gz
cd package
python setup.py install
针对whl需要pip
pip install package.whl
即可。
针对报错,可能会有依赖不存在而抱错
如
Installed /public/home/wangwen_lab/zhangjiexiong/anaconda3/lib/python3.8/site-packages/ont_fast5_api-3.0.0-py3.8.egg
Processing dependencies for ont-fast5-api==3.0.0
Searching for progressbar33>=2.3.1
Reading https://pypi.org/simple/progressbar33/
^Cinterrupted
或者
WARNING: Retrying (Retry(total=0, connect=None, read=None, redirect=None, status=None)) after connection broken by 'NewConnectionError('<pip._vendor.urllib3.connection.HTTPSConnection object at 0x7f8ae26bcc10>: Failed to establish a new connection: [Errno 101] Network is unreachable')': /simple/numpy/
ERROR: Could not find a version that satisfies the requirement numpy==1.18.5 (from fast5mod==1.0.5) (from versions: none)
ERROR: No matching distribution found for numpy==1.18.5 (from fast5mod==1.0.5)
这里我直接ctrl+c了,因为我不可能连的上网站
我们需要去前面的网站里面找到对应的模块,把这个依赖的包下下来,再用上述的方法重新安装一次,如果又碰到依赖报错那就再来一次,报错哪个装哪个,直到最后肯定都会装完的。