在上周,我们在社群讨论。安装R包是个玄学”
有时候真的很奇怪,在自己的电脑上就是无法安装,但是在其他电脑都可以正常安装…,不是感到很无语????
没有办法,类似的问题,我个人认为不止只有那么几个人遇到,可能所有人都有遇到。当我们遇到这样的问题时,你是如何解决的的呢???我们这边提供的办法:一是换网络继续安装
(PS:可能无济于事,因为类似这样的问题,网络只是很小的问题);二是从其他电脑中拷贝安装包过来
(PS:这个可能是一个不错的办法,但是前提是你手中有其余的电脑,以及可以正常安装);三是关机大法
(PS:可能有用,可能无效)。
我们在开始分析的第一步,都会遇到各种奇葩的问题。以及,有些问题真的很心烦。不是说它很难,二是在于你知道是这个问题,但是无法解决。原本是很简单的分析,结果你连第一步都无法跨域
。
那么,我们就想,是否大家可以将所有的R包都下载后,我们就可以直接使用。嗯哼!!不错的办法,那么就有了今天的R包分享教程。刚开始,我想建立一个共享文件,大家可以将自己的R包免费上传后,这样有利于R包的多样性,以及可以不停的丰富R包的数量。但是,后面有同学及时提醒“防人之心不可无”
,因此,这个提议立马被自己毙掉。因此,我们这边分享的R包就只是自己手中的。大概有18G左右
,我猜想基本可以满足80%的同学日常需求。
若你需要本期的教程,请回复关键词:20240121
若我们的分享对你有用,希望您可以点赞+收藏+转发,这是对小杜最大的支持。
我们压缩后的大小为12G
,因此大家获得后可以直接解压使用即可。
由于数据量太大,百度云盘无法上传,其他的平台免费空间也只有10G。最终选择使用阿里云盘来分享。希望,这个盘不要蹦掉。崩掉后自己也不知道如何来分享。因此,大家若需要,请尽快下载,早下载早得。
解压命令:
使用多线程解压:Linux服务器中tar多线程压缩/解压文件
## 若你没安装pigz
mamba install -y pigz
## 解压命令
tar --use-compress-program=pigz -xvpf ***.tar.gz
这个教程,也是我们2021年开始分享时前几个教程,也还是有用的,大家可以在服务器或本地中修改路径使用。
.libPaths("/home/Data/refdir/Rlib") ## 输入你的路径
myPaths <- c("/home/Data/refdir/Rlib")
.libPaths(myPaths)
若我们的分享对你有用,希望您可以点赞+收藏+转发,这是对小杜最大的支持。
1. 复现SCI文章系列专栏
2. 《生信知识库订阅须知》,同步更新,易于搜索与管理。
3. 最全WGCNA教程(替换数据即可出全部结果与图形)
4. 精美图形绘制教程
5. 转录组分析教程
一个转录组上游分析流程 | Hisat2-Stringtie
小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学的教程,以及基于R的分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!!