通过对ClassifyCNV CNV注释工具进行封装,只输入染色体编号+CNV起始位置+CNV结束位置,即可对该区域进行注释,并对结果进行格式化输出,保留原结果主要信息,精简结果文件。
CNV注释软件可参考本人以下文章:
生信软件11 - 基于ACMG的CNV注释工具ClassifyCNV
import pandas as pd
import os
import argparse
# import configparser
# 配置文件,根据需求设置
# file_config = configparser.ConfigParser()
# file_config.read('/public/config.ini')
class AnnoCNV