生信技能35 - WisecondorX多分辨率CNV检测的程序封装

WisecondorX软件基本用法

参考本人以下文章，进行参考reference的构建。

生信软件4 - 拷贝数变异CNV分析软件 WisecondorX

1. 配置文件

文件名称config.ini ， 包含参考reference各分辨率检测对应的参考文件

[reference]
reference_20kb = /reference/reference_20k.npz
reference_100kb = /reference/reference_100k.npz
reference_200kb = /reference/reference_200k.npz

2. CNV calling 脚本封装

程序为python编写，文件名称analysisCNV.py

import pandas as pd
import os