[VASP learning]用MS绘制矩形格子石墨烯

目录

1.获得初始结构

2.得到单层石墨的超胞

3.变换基矢

4.修改原子坐标高度（非必须）

5.扩胞

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1.获得初始结构

File-Import-structure-搜索graphite.msi 导入MS预设石墨结构

也可以从Crystallography Open Database、Materials Project等网站获取：

Crystallography Open Database: Searchhttps://www.crystallography.net/cod/search.html

?Materials Project - Homehttps://next-gen.materialsproject.org/

2.得到单层石墨的超胞

Build-symmetry-supercell-create supercell 将当前原胞转化为超胞，解除原子周期性，然后删除一层原子，得到有4个C原子的超胞

3.变换基矢

现在的基矢、夹角为120°，我们要将他变换为90°。

画一个坐标图分析，不难看出在AOB坐标系中，A'坐标为(2,1,0)

Build-Symmetry-Redefine Lattice，输入A坐标为（2 1 0），Redefine?

4.修改原子坐标高度（非必须）

为了方便后续计算和符合计算习惯，我通常在z方向为0的高度搭建表面原子

由于周期性显示，相对坐标系中z=0和z=1是同一个原子，所以看上去出现了两层碳原子

5.扩胞

有两种方法

1）用第三步变换基矢的方法

Build-Symmetry-Redefine Lattice，输入A (2 0 0), B (0 4 0), Redefine?

2）用第二步得到超胞的方法对晶胞进行扩胞

Build-Symmetry-Supercell 设置A B C方向的扩胞倍数

6.设置真空层高度

表面计算的Slab模型需要设置真空层，关于Slab模型可以参考大师兄的博客：

Ex42 slab模型 | Learn VASP The Hard Way (bigbrosci.com)https://www.bigbrosci.com/2018/08/25/ex42/

Build-Crystals-Rebuild Crystal...?

Lattice Parameters 设置c方向为10，即10埃的真空层

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特别感谢四川大学岑望来老师对我Material Studio的指导！