Group k-fold解释和代码实现
0,1,2,3:每一行表示测试集和训练集的划分的一种方式。
class:表示类别的个数(下图显示的是3类),有些交叉验证根据类别的比例划分测试集和训练集(例三)。
group:表示从不同的组采集到的样本,颜色的个数表示组的个数(有些时候我们关注在一组特定组上训练的模型是否能很好地泛化到看不见的组)。举个例子(解释“组”的意思):我们有10个人,我们想要希望训练集上所用的数据来自(1,2,3,4,5,6,7,8),测试集上的数据来自(9,10),也就是说我们不希望测试集上的数据和训练集上的数据来自同一个人(如果来自同一个人的话,训练集上的信息泄漏到测试集上了,模型的泛化性能会降低,测试结果会偏好)。
X, y = np.arange(0,60).reshape((30,2)), np.hstack(([0] * 3, [1] * 9, [2] * 18))
groups = np.hstack((["a"] * 3, ["b"] * 1,["c"] * 2, ["d"] * 4,["e"] * 5, ["f"] * 3,["g"] * 4,["h"] * 5, ["i"] * 3))
print("数据:", end=" ")
for l in X:
print(l, end=' ')
print("")
print("标签:", y)
print("组别:", groups)
数据: [0 1] [2 3] [4 5] [6 7] [8 9] [10 11] [12 13] [14 15] [16 17] [18 19] [20 21] [22 23] [24 25] [26 27] [28 29] [30 31] [32 33] [34 35] [36 37] [38 39] [40 41] [42 43] [44 45] [46 47] [48 49] [50 51] [52 53] [54 55] [56 57] [58 59]
标签: [0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2]
组别: ['a' 'a' 'a' 'b' 'c' 'c' 'd' 'd' 'd' 'd' 'e' 'e' 'e' 'e' 'e' 'f' 'f' 'f' 'g' 'g' 'g' 'g' 'h' 'h' 'h' 'h' 'h' 'i' 'i' 'i']
数据个数、标签个数:30个
类别个数:3个(分别是0,1,2,比例是0.1:0.3:0.6和class每类对应)(和类别无关)
组别(group):9个(分别是a-i,个数是3,1,2,4,5,3,4,5,3)
代码如下:
# Group k-fold
import numpy as np
from sklearn.model_selection import GroupKFold
# X = [0.1, 0.2, 2.2, 2.4, 2.3, 4.55, 5.8, 8.8, 9, 10]
# y = ["a", "b", "b", "b", "c", "c", "c", "d", "d", "d"]
# groups = [1, 1, 1, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3]
X, y = np.arange(0,60).reshape((30,2)), np.hstack(([0] * 3, [1] * 9, [2] * 18))
groups = np.hstack((["a"] * 3, ["b"] * 1,["c"] * 2, ["d"] * 4,["e"] * 5, ["f"] * 3,["g"] * 4,["h"] * 5, ["i"] * 3))
print("数据:", end=" ")
for l in X:
print(l, end=' ')
print("")
print("标签:", y)
print("组别:", groups)
gkf = GroupKFold(n_splits=3)
for i,(train, test) in enumerate(gkf.split(X, y, groups=groups)):
print("=================Group k-fold 第%d折叠 ===================="% (i+1))
# print('train - {}'.format(np.bincount(y[train])))
print(" 训练集索引:%s" % train)
print(" 训练集标签:", y[train])
print(" 训练集组别标签", groups[train])
print(" 训练集数据:", end=" ")
for l in X[train]:
print(l, end=' ')
print("")
# print(" 训练集数据:", X[train])
# print("test - {}".format(np.bincount(y[test])))
print(" 测试集索引:%s" % test)
print(" 测试集标签:", y[test])
print(" 测试集组别标签", groups[test])
print(" 测试集数据:", end=" ")
for l in X[test]:
print(l, end=' ')
print("")
# print(" 测试集数据:", X[test])
print("=============================================================")
结果如下:
数据: [0 1] [2 3] [4 5] [6 7] [8 9] [10 11] [12 13] [14 15] [16 17] [18 19] [20 21] [22 23] [24 25] [26 27] [28 29] [30 31] [32 33] [34 35] [36 37] [38 39] [40 41] [42 43] [44 45] [46 47] [48 49] [50 51] [52 53] [54 55] [56 57] [58 59]
标签: [0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2]
组别: ['a' 'a' 'a' 'b' 'c' 'c' 'd' 'd' 'd' 'd' 'e' 'e' 'e' 'e' 'e' 'f' 'f' 'f'
'g' 'g' 'g' 'g' 'h' 'h' 'h' 'h' 'h' 'i' 'i' 'i']
=================Group k-fold 第1折叠 ====================
训练集索引:[ 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21]
训练集标签: [1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2]
训练集组别标签 ['b' 'c' 'c' 'd' 'd' 'd' 'd' 'e' 'e' 'e' 'e' 'e' 'f' 'f' 'f' 'g' 'g' 'g'
'g']
训练集数据: [6 7] [8 9] [10 11] [12 13] [14 15] [16 17] [18 19] [20 21] [22 23] [24 25] [26 27] [28 29] [30 31] [32 33] [34 35] [36 37] [38 39] [40 41] [42 43]
测试集索引:[ 0 1 2 22 23 24 25 26 27 28 29]
测试集标签: [0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2]
测试集组别标签 ['a' 'a' 'a' 'h' 'h' 'h' 'h' 'h' 'i' 'i' 'i']
测试集数据: [0 1] [2 3] [4 5] [44 45] [46 47] [48 49] [50 51] [52 53] [54 55] [56 57] [58 59]
=============================================================
=================Group k-fold 第2折叠 ====================
训练集索引:[ 0 1 2 3 6 7 8 9 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29]
训练集标签: [0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2]
训练集组别标签 ['a' 'a' 'a' 'b' 'd' 'd' 'd' 'd' 'g' 'g' 'g' 'g' 'h' 'h' 'h' 'h' 'h' 'i'
'i' 'i']
训练集数据: [0 1] [2 3] [4 5] [6 7] [12 13] [14 15] [16 17] [18 19] [36 37] [38 39] [40 41] [42 43] [44 45] [46 47] [48 49] [50 51] [52 53] [54 55] [56 57] [58 59]
测试集索引:[ 4 5 10 11 12 13 14 15 16 17]
测试集标签: [1 1 1 1 2 2 2 2 2 2]
测试集组别标签 ['c' 'c' 'e' 'e' 'e' 'e' 'e' 'f' 'f' 'f']
测试集数据: [8 9] [10 11] [20 21] [22 23] [24 25] [26 27] [28 29] [30 31] [32 33] [34 35]
=============================================================
=================Group k-fold 第3折叠 ====================
训练集索引:[ 0 1 2 4 5 10 11 12 13 14 15 16 17 22 23 24 25 26 27 28 29]
训练集标签: [0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2]
训练集组别标签 ['a' 'a' 'a' 'c' 'c' 'e' 'e' 'e' 'e' 'e' 'f' 'f' 'f' 'h' 'h' 'h' 'h' 'h'
'i' 'i' 'i']
训练集数据: [0 1] [2 3] [4 5] [8 9] [10 11] [20 21] [22 23] [24 25] [26 27] [28 29] [30 31] [32 33] [34 35] [44 45] [46 47] [48 49] [50 51] [52 53] [54 55] [56 57] [58 59]
测试集索引:[ 3 6 7 8 9 18 19 20 21]
测试集标签: [1 1 1 1 1 2 2 2 2]
测试集组别标签 ['b' 'd' 'd' 'd' 'd' 'g' 'g' 'g' 'g']
测试集数据: [6 7] [12 13] [14 15] [16 17] [18 19] [36 37] [38 39] [40 41] [42 43]
=============================================================
进程已结束,退出代码 0
可以看到测试集标签里面有0,但是训练集标签里没有0——这没办法做测试。
可以看到数据集的划分和组别和折叠数(3折)有关,但是和标签比例无关(这一点不科学)
=================Group k-fold 第1折叠 ====================
训练集索引:[ 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21]
训练集标签: [1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2]
训练集组别标签 ['b' 'c' 'c' 'd' 'd' 'd' 'd' 'e' 'e' 'e' 'e' 'e' 'f' 'f' 'f' 'g' 'g' 'g' 'g']
训练集数据: [6 7] [8 9] [10 11] [12 13] [14 15] [16 17] [18 19] [20 21] [22 23] [24 25] [26 27] [28 29] [30 31] [32 33] [34 35] [36 37] [38 39] [40 41] [42 43]
测试集索引:[ 0 1 2 22 23 24 25 26 27 28 29]
测试集标签: [0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2]
测试集组别标签 ['a' 'a' 'a' 'h' 'h' 'h' 'h' 'h' 'i' 'i' 'i']
测试集数据: [0 1] [2 3] [4 5] [44 45] [46 47] [48 49] [50 51] [52 53] [54 55] [56 57] [58 59]
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Group k-fold:不考虑标签(class)和组(group)的影响。