MR image smoothing or filtering 既 FWHM与sigma之间的换算关系 fslmaths -s参数

发布时间：2024年01月24日

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大量的文献中都使用FWHM 作为单位，描述对MR等数据的平滑（smoothing）或者滤波（filtering）过程。FWHM 通常是指full width at half maximum的缩写，

然而，在当前不少的MR处理工具中，提供的参数是高斯滤波核中的sigma, i.e., σ \sigma σ。如果错误地把FWHM 当作 σ \sigma σ，那么数据就会过平滑，造成错误。

# Smoothing code 
fslmaths input_t1.nii.gz -s 2.12 smoothed_t1.nii.gz

FWHM核高斯核中的sigma是有一个换算公式：

F W H M = σ ? 2.354 FWHM=\sigma * 2.354 FWHM=σ?2.354。下面列出一些常用的FWHM与 σ \sigma σ的对应关系，以供后面使用。

FWHM σ \sigma σ
8 mm~ 3.40
7 mm~ 2.97
6 mm~ 2.55
5 mm~ 2.12
4 mm~ 1.70
3 mm~ 1.27
2 mm~ 0.85
1 mm~ 0.42
0.8 mm~ 0.34
0.7 mm~ 0.30
0.5 mm~ 0.21

结果

几种不同的核的结果

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文章来源:https://blog.csdn.net/auto_star/article/details/135817436
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