分子动力学模拟—LAMMPS 模拟(固体和液体)数据后处理软件(六)

发布时间:2024年01月18日

图片


================================

记录一下检索到一篇分子动力学模拟数据后处理的软件。

感谢论文的原作者!

主要功能:


Structure Analysis

    • Ackland Jones Analysis

    • CentroSymmetry Parameter

    • Common Neighbor Analysis

    • Common Neighbor Parameter

    • Atomic Structure Entropy

    • Steinhardt Bondorder

    • Radiul Distribution Function

    • Polyhedral Template Matching

    • Identify stacking faults (SFs) and twinning boundary (TBs)

  1. Potential Analysis

    • Generate EAM/alloy Potential

    • Read EAM/alloy Potential

    • Average EAM/alloy Potential

    • Calculate Atomic Force and Energy by EAM/alloy

  2. Melting Analysis

    • Mean Squared Displacement

    • Lindemann Parameter

    • Identify Solid/Liquid Phase

  3. Geometry Structure Creation

    • Generate Standard Lattice Structure

    • Generate Polycrystal

  4. Neighbor Search

    • Neighbor Atoms within Fixed Distance

    • Neighbor Atoms within Fixed Number

  5. I/O

    • Load Dump, Data, POSCAR, XYZ format

    • Export Dump, Data, POSCAR, XYZ format

  6. Other

    • Void Distribution

    • Cluster Analysis

    • Replication

    • Warren Cowley Parameter

    • Identify species

    • Average Atomic Temperature

    • Atomic Voronoi Volume

    • Multi-dimensional Spatial Binning

    • Parallelly Compress file to .gz format


Figure 1

图片

Figure 2

图片

Figure 3

图片

Figure 4

图片

Figure?5

图片


================================

图片

以上是我们分享的一些经验或者文章的搬运,或有不足,欢迎大家指出!

如有侵权,请联系我立马删除!

详细内容(文章题目、文章链接、附件下载)可在微 信 公 众 号原子与分子模拟获取,欢迎大家关注。

文章来源:https://blog.csdn.net/nmrwxw/article/details/135685193
本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。